宋慈（何冰 飾）參加京試中了進士，預備返家完婚後隨同科好友孟良臣（吳軍 飾）赴邊城。豈知，直至完婚那日，宋慈父親宋鞏依舊未歸家。兩位新人正拜堂之際，一輛馬車卻載回了父親的遺體，宋鞏一生從事刑獄審戡，從未出錯，卻因一次誤判人命功虧一簣，這是以死謝罪，還留下遺書禁止宋門後代涉足刑獄。

　　豈料，禍不單行，孟良臣在上任途中被謀殺的噩耗傳回。在母親的勸導下，宋慈動身邊城，為摯友查明了案情，還它清白。由此，宋慈被破格提升為大理寺正六品主事，後又被任命外省提點刑獄。宋慈接連查明偵破了「太平縣冤案」、「李府連環案」、「毛竹塢無頭案」、「城南井屍案」、「遺扇嫁禍案」、「梁雨生命案」、「李玉姑失蹤案」等一樁又一樁的懸案……